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無菌室(或半無菌室)是進行微生物學質量檢測的操作用室。對制劑的微生物學質量要求分為無菌要求和衛生學標準兩種,對要求無菌的,如注1射劑、眼用制劑等,制定了無菌要求,需要在無菌室中進行檢測,設計中采用10000級潔凈環境下設置超凈工作臺來實現;對不要求完全無菌的一般制劑,但又不允許某些菌的存在,并且對于允許存在的菌落數又加以限制,在這種情況下,提出了衛生學標準,如:內服固體制劑、內服液體制劑、外用制劑等,可在半無菌室中進行檢測,設計中采用在100000級潔凈環境下設置超凈工作臺來實現。
無菌室(或半無菌室)是潔凈區域,應按GMP對潔凈區的要求進行設計,人員進入需設置更衣及緩沖間,物料或物品進入也應設置緩沖(或傳遞窗),培養皿、培養基等均需進行滅菌方能進入。無菌室在能直接被外界觀察到的地方,設置觀察窗,已確保操作人員的安全?？照{機房就近設置,縮短送回風管路,同時還應設置配套的培養間、衛生學準備間、清洗間、滅菌間等。
潔凈實驗室用房宜與辦公用房等其他功能用房分開設置。建筑規模較大、有條件的，理化、微生物、毒理等實驗室宜設置建筑單體，各類實驗室建筑相對集中，合理分區，宜處于1小風頻上風向。三級生物安全防護實驗室建筑宜單獨設置，四級生物安全防護實驗室建筑應單獨設置。 各類實驗用房集中在一個樓宇的，垂直布局從上至下宜按照毒理（實驗動物房）、理化、微生物依次安排。業務、實驗、行政及保障等各類功能用房集中在一個樓宇的，實驗部分宜置于樓宇上部?！叭龔U”處理與排放以及醫1療垃圾處理設施應符合環境保護等相關法律、法規的要求。
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在高等院校和研究院所實驗室中，潔凈實驗室是對相關空氣和環境參數給予特別設計的一種實驗室類型。按照國家標準，科學實驗室分為兩類，一類為普通實驗室，一類為實驗室。
實驗室定義為有特定環境要求(如恒溫、恒濕、潔凈、無菌、防振、防輻射、防電磁干擾等)或以精密、大型、特殊實驗裝置為主(如電子顯微鏡、天平、譜儀等)的實驗室。
這一類實驗室大都需要建設凈化空調系統，隨著科學技術的飛速發展和綜合國力的提高，凈化實驗室在高校和研究院所實驗室中所占的比例逐年提高。
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